متن كامل پيام رهبر معظم انقلاب به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
شهادت استاد دانشمند مرحوم آقاي دكتر مسعود علي‌محمدي رضوان الله عليه را به مادر و همسر و خاندان گراميش و به همه‌ دوستان و شاگردان و همكارانش تبريك و تسليت عرض مي‌كنم.
دست جنايتكاري كه اين ضايعه را آفريد، انگيزه‌ دشمنان جمهوري اسلامي را كه ضربه زدن به حركت و جهاد علمي كشور است، افشاء و برملا كرد. بي‌گمان همت دانشمندان و استادان و دانش پژوهان كشور، به رغم دشمن،‌ اين انگيزه‌ خباثت آلود را ناكام خواهد گذاشت. علوّ درجات آن شهيد سعيد و صبر و اجر بازماندگان را از خداوند متعال مسألت مي‌كنم.
سيّدعلي خامنه اي
25/ديماه/1388